Perkembangan Fakultas Peternakan dan Pertanian Universitas Diponegoro (FPP UNDIP) sangat dinamis dimulai dari lahirnya Fakultas Peternakan Universitas Diponegoro pada tanggal 1 September 1964 dengan Surat Keputusan Menteri Perguruan Tinggi dan Ilmu Pengetahuan Nomor 75/1964 tertanggal 17 Juli 1964. Dalam perkembangannya Fakultas Peternakan Universitas Diponegoro berganti nama menjadi Fakultas Peternakan dan Pertanian Universitas Diponegoro pada tahun 2012 dengan dengan persetujuan Rektor Undip yaitu SK Rektor No. 724/SK/UN7/2011 tanggal 8 Desember 2011 tentang Penetapan Perubahan nama Fakultas Peternakan Undip menjadi Fakultas Peternakan dan Pertanian, dan dalam perkembangannya FPP UNDIP mengelola beberapa Program Studi (PS) : empat program studi S1 (PS S1 Peternakan, PS S1 Teknologi Pangan, PS S1 Agroekoteknologi, PS S1 Agribisnis); dua program studi S2 (PS Magister Ilmu Ternak, PS Magister Agribisnis); dan satu program studi S3 (PS Doktor Ilmu Ternak).
Program Studi Magister Agribisnis Fakultas Peternakan dan Pertanian Universitas Diponegoro (PS Magister Agribisnis FPP UNDIP) berdiri pada 21 Desember 2006 dengan SK Dirjen Dikti No 4907/D/T/2006. Pembukaan PS Magister Agribisnis FPP UNDIP sendiri terjadi mengingat besarnya tuntutan masyarakat akan pengembangan sektor agribisnis. Pengembangan itu sendiri dalam bentuk ilmu pengetahuan dan perluasan usaha di bidang agribisnis. Ditambah dengan potensi agribisnis yang sangat besar di daerah Jawa Tengah menyebabkan lahirnya PS Magister Agribisnis FPP UNDIP.
